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Généralités

01- Introduction à la virologie


02- Le cytosquelette : transport viral et altération viro-induite

- Les microfilaments d'actine
- Les microtubules
- Les filaments intermédiaires
- Rôle du cytosquelette dans le transport viral
- Altérations viro-induites du cytosquelette


03- Transport intracellulaire

- Organisation cellulaire
- Différents modes de transport des protéines

    Translocation
    Diffusion
    Transport vésiculo-tubulaire
- Mécanisme moléculaire du traffic vésiculo-tubulaire dans les voies de biosynthèse/sécrétion   d'endocytose
    Les vésicules formées par les coatomères COP
    Les vésicules à clathrine
    Les autres types de vésicules
- Exemples d'intéraction entre des protéines virales et cellulaires
    Modification de l'expression de protéines à la surface cellulaire
    Interactions directes entre des protéines virales et des protéines cellulaires impliquées dans
    le transport vésiculaire
- Méthodes d'analyse du transport des protéines
    In vitro
    In vivo


04- Mécanisme moléculaire du transport nucléaire

- Les pores nucléaires
- Le NLS (Nuclear Localisation System)
- Structure des pores nucléaires (NPC)
- Le transport nucléaire actif
   
Fixation (Docking) de la protéine possédant un NLS sur la face cytoplasmique du NPC
    Import dans le noyau et désassemblage du complexe d'importation


05- Apprétage et présentation des antigènes dans le contexte CMH classe I

- Introduction
    Les gènes de classe I
    Les gènes de classe II
    Les gènes de classe III
- Présentation antigénique par la molécule d'histocompatibilité de classe I
   
La molécule d'histocompatibilité de classe I
    Six postulats
        Origine endogène exclusive des peptides présentés par les molécules d ‘histocompatibilité de classe I
        Dégradation exclusivement cytosolique
        Présentation antigénique par les molécules d’histocompatibilité de classe I et protéolyse dépendante
        de l’ubiquitine
        Les peptides de classe I produits dans le cytosol sont acheminés dans le réticulum endoplasmique par
        les pompes à peptides associées au CMH
        Association de peptides aux molécules d’histocompatibilité dans le réticulum endoplasmique :
        processus passif ?
        Règles de fixation dans la grotte des molécules d’histocompatibilité de classe I

- Interférence virale
- Conclusion


06- Reconnaissance des antigènes dans le contexte CMH classe II

- Présentation de l'antigène au cellule T CD4+ par les molécules du CMH de classe II
   
L'activation des cellules T auxiliaires nécessite la présence de cellules présentant l'antigène
    L'interaction macrophages-cellules T helper (CD4+) est restreinte par les antigènes du CMH II
    Mise en évidence du phénomène de "Processing"
    Le "Processing" de l'antigène aboutit à sa fragmentation en peptides
    Le complexe CMH-peptide
- Dégradation des protéines et en fragment peptidique
- Transport des molécules de classe II en fonction de la chaine invariante Li
- Compartiments cellulaires impliqués dans l'association des molécules de classe II
   au peptide antigénique
- Les cellules spécialisées dans la présentation de l'antigène, restreintes par les
   molécules de classe II du CMH
    Les macrophages
    Les cellules dendritiques
    Les lymphocytes B


07- Stratégie de survie des virus et défense de l’hôte

- Les antigènes viraux et leur reconnaissance par le système immunitaire
- Immunité «naturelle» vis à vis des infection virales
- Cellules tueuses naturelles (NK) : rôle dans la cytolyse des cellules infectées ou rôle    secrétoire
- Rôles des anticoprs spécifiques dans la prévention et la guériqon de certaines infections    virales
- Mécanismes d'action des anticorps viraux
- Le phénomène du «cross help»
- Rôles des effecteurs lymphocytaires T dans le contrôle des infections virales
   
Fonction cytotoxique des lymphocytes T anti-viraux
    Sécrétion d'interféron gamma par les lymphocytes T immuns et son rôle dans la reconnaissance
    des antigènes viraux
- Conclusion


08- Neutralisation des virus animaux


09- Pathogénèse des infections virales neurotropes

- Les mécanismes de persistances virales
    Régulation du potentiel lytique
         Restriction de l'expression de gènes viraux
         Génération de variant viraus
    Echappement au système immunitaire
         Les effecteurs spécifiques contrôlant l'infection virale
       
  Les moyens d'échappement au système immunitaires
- Les sites de persistances virales
    Généralités
    Le système nerveux central
         Données anatomiques sur le SNC
         Infections persistantes du SNC

- Les déterminants génétiques viraux de la persistances
    Généralités
    Le virus de la ChorioMéningite lymphocytaire (LCMV)


10- Neuro-immunologie virale

- Action du système immunitaire dans le système nerveux central
    La privilège immun
    La barrière hémato-méningé (Blood Brain Barrier / BBB)
    La faible expression des molécules de présentation des'antigènes (CMH) dans le SN
    est un phénomène actif
    Les cellules présentatrices d'antigène (CPA)
    Destruction des lymphocytes activés
    Cytokines immunodépressives
    Echappement du système
    Illustration avec le virus de la rage
- Action du système nerveux sur le système immunitaire


11- Le cycle cellulaire

- Un milliard de cellule par gramme de tissu
- Les phases du cycle cellulaire
- Le contrôle du cycle cellulaire
    Fonctions des différents complexes cdk/cycline
         Les cdk associées aux cyclines de G1
         Les cdk associées aux cyclines mitotiques
         Les autres complexes cdk/cycline

   
Régulation des cdk
         Régulation des cdk par les cyclines
         Régulation par phosphorylation
         Régulation par les CKI (Cyclin Dependant Kinase Inhibitor)

    Les inhibiteurs chimiques de cdk


12- Les complexes d’initiation de la transcription


13- Transactivation des promoteurs viraux (HIV: Tax et Tat)


14- Introns, épissage des ARNs et nucléase intronique


15- Contrôle traductionnel


16- Voies de signalisation par les interférons


17- Mécanismes d’action antivirales des interférons


18- Apoptose en virologie


19- Cancer, proto- et anti-oncogène